그러나 혈족들과 대영주들은 콘치니의 막강한 권력을 인정할 수 없었고 앙리 4세 때 약화되었던 그들의 권한을 되찾으려 하였다. (콩데 공, 콩티 공, 수아송 백작, 방돔 공작, 기즈 공작, 롱그빌 공작, 부이용 공작 등) 1614년 섭정 마리와 콘치니에 반대하는 귀족들은 콩데를 사령관으로 삼아 결집했다. 그들은 "국왕의 시대는 이제 가고 왕족과 대귀족의 시대가 다가오고 있다" 고 말했다. 마리는 그들에게 연금을 지급하여 달래려고 하였으나 제대로 관리되지 않는 재정은 금새 바닥을 보이기 시작했다. 또한 아들 루이 13세를 에스파냐 공주 안 도트리슈와, 딸 엘리자베스 공주를 에스파냐의 왕위계승자 펠리페(후의 펠리페 4세)와 결혼시키고자 하는 마리의 생각은 신교도들에게 위협을 느끼게 했다. 따라서 각층의 불만을 무마시키기 위해, 마리는 결국 1614년 10월 삼부회를 열었다. 그러나 삼부회에서 세 신분들은 서로의 이익만을 주장하다 결국 1615년 해산하고 말았고, 뤼송의 주교인 리슐리외를 부각시키는 효과만 낳았다. 이전까지 크게 돋보이지 않았던 젊은 주교 리슐리외는 이때 뛰어난 웅변으로 섭정 모후 마리의 눈에 들었다. 삼부회에서 그의 연설의 주된 내용은 성직자는 자식이 없으므로 이 세상에 남길 것이 없고, 따라서 국왕과 조국에 정성을 다하여 전념할 것이므로 성직자에게 국정을 맡겨야 한다는 것이었다. 그리고 그의 일생은 이 연설의 실천과도 같았다. 삼부회가 결렬된 후 1615년과 1616년은 귀족들과 신교도들의 반란으로 나라 전체가 혼란에 빠졌다. 그러나 1616년 콩데 공이 체포되고 콘치니가 내각을 개편하면서 회복의 기미를 보이기 시작했다. 이 때 리슐리외가 국가비서로서 정부에 들어갔다.

그러나 1614년에 성년이 되고 1615년에 안 도트리슈와 결혼한 루이 13세는 침묵하고 있었지만 생각을 하고 있지 않은 것은 아니었다. 그는 1617년 4월 26일 콘치니를 암살하고 친정을 선포했다. 아무도 예상치 못한 사건이었다. "그렇다, 이제 짐이 국왕이니라" 라는 루이 13세의 선포에 모든 사람들이 환호했고 콘치니의 내각은 파괴되었으며 모후는 블루아로 추방되었다.

그러나 결과적으로 그다지 크게 달라진 것은 없었다. 콘치니 대신 국왕의 총애를 받던 샤를 알베르 드 륀이 그 자리를 차지했다. 이제껏 모후와 대결하던 귀족들은 모후를 중심으로 결집하기 시작했다. 1619년 2월 22일 모후는 블루아 성을 탈출하기 위해 40M나 되는 높이를 밧줄계단을 타고 내려왔다. 1620년 모후와 귀족들은 귈기했다. 그러나 퐁-드-세에서 왕의 군대에게 패주하고 말았다. 이 때 리슐리외가 모후와 왕 사이의 대화를 이어주어 모후는 용서를 빌고 파리로 돌아오고 귀족들도 표면적으로는 잠잠해졌다.

신교도들의 위협도 심각했다. 루이 13세와 륀은 여러번 신교도들의 봉기를 진압했으나 1622년 몽펠리에 앞에서의 패배로 낭트 칙령을 갱신해야만 했다. 1621년 신교도들과 싸우는 와중에 성홀열로 륀이 사망했다.

왕은 모후파라는 생각 때문에 리슐리외를 싫어했다. 그러나 확고한 지도력을 가진 인사가 별달리 없었기 때문에 1624년 리슐리외를 어쩔 수 없이 국왕참사회에 받아들였다. 이에는 왕과 추기경의 비밀회담을 마련한 조제프 트랑블레 수사의 역할이 컸다.

당시 프랑스의 상황은 대외적으로도 대내적으로도 좋지 않았다. 모후의 친가톨릭 정책으로 합스부르크 가의 힘이 커져서 프랑스는 포위될 지경에 이르렀다. 또한 리슐리외가 국왕 참사회에 들어간 후 친 에스파냐인 모후파였던 그가 노선을 전환하여 "선량한 프랑스인"으로 대표되는 반 에스파냐 파로 돌아서자 리슐리외를 제거하려는 모후와 귀족들의 음모가 계속되었다. 그 중심인물을 모후 마리 드 메디시스, 왕제 가스통 도를레앙, 왕비 안 도트리슈, 그녀가 총애하는 슈브뢰즈 공작부인 마리 드 로앙(원래 륀의 아내였음)이었다. 1626년 슈브뢰즈 공작부인은 자신에게 푹 빠져있는 왕족 샬레 백작을 음모의 수뇌로 앉혔다. 이 음모는 추기경과 함께 국왕까지 제거하여 왕제 가스통 도를레앙을 왕위에 앉히고 왕비 안 도트리슈를 그와 재혼시키자는 것이었는데, 사실 샬레 백작은 슈브뢰즈 공작부인의 뜻에 충실히 따르려고 한 것 뿐, 음모 자체에는 관심이 없었다. 왕비, 슈브뢰즈 공작부인, 모후는 물론 가브리엘 데스트레의 아들들인 방돔 공작 세자르와 몰타의 대수도원장 알렉상드르도 가담했다. 음모의 내용은 왕제와 친구들이 숲속에서 사냥을 하다가 해진 뒤 리슐리외에게 식사와 거처를 요구하며 일부러 언쟁을 일으켜 리슐리외를 해치우자는 것이었다. 그러나 항상 결정적인 순간마다 심약해 지는 왕제는 이번에도 몸이 아프다며 뒤로 빠졌고 경솔한 샬레 백작이 음모를 함부로 누설하는 바람에 음모자들은 모두 체포되었다. 왕제와 모후는 음모와 아무 관련이 없다고 용서를 빌었고, 신분이 너무나 높았던 덕에 처벌받지 않았으며 왕제는 엄청나게 강대하고 부유한 몽팡시에 가문의 딸과 결혼해 오를레앙 공작을 제수받았다. (원래는 앙주 공작으로 가스통 당주 라고 불렸다.) 그러나 샬레 백작은 낭트에서 처형되었고 슈브뢰즈 공작부인은 당피에르 성으로 추방되어 남편의 감시 아래 놓이게 되었다 .몽모랑시 공작 앙리도 제거되었고, 방돔 공작은 4년 동안 벵센의 탑에 갇혀 있다가 풀려났으며 몰타 대 수도원장은 형과 함께 갇혀있다 2년 만에 죽었다. 다른 음모자들은 들키지 않았거나 도망쳤다. 이 중에서 신분이 높은 왕족인 샬레 백작의 끔찍한 처형(사형집행을 늦추기 위해 샬레 백작의 친구들이 사형집행인을 납치했으나 리슐리외는 사형수에게 사면을 약속하고 백작을 처형토록 했다. 익숙치않은 그는 통 제조공의 손도끼를 들고 샬레 백작을 처형했는데 제대로 하지 못해 무려 36번이나 내리쳐야 했다. 샬레 백작은 20번째까지도 신음소리를 냈다고 한다.)은 대귀족들에게 공포심을 자아냈다.

그러나 이 사건으로 인해 리슐리외는 국왕의 신임을 더 얻게 되었고 귀족들에 대한 강경한 처벌은 계속 이어졌다. 리슐리외는 귀족들의 결투를 금지하는 칙령을 발표했는데, 이는 대외적인 전쟁을 하지 않는 귀족들이 그 정열을 자기들끼리 쏟아내는 것을 방지하기 위함이었고, 다른 이유는 결투를 빌미로 음모를 꾸미는 것을 막기 위해서였다. 몽모랑시 부트빌 백작이 1627년 6월 결투 금지 칙령을 어겨 그 칙령이 발표된 루아이얄 광장에서 처형되었다. 이후에도 귀족들의 음모가 계속되었으나 그때마다 강경하게 진압되었다.

신교도들도 마찬가지였다. 루이 13세와 리슐리외는 1627년∼28년에 신교도들의 근거지 중 하나인 라 로셸을 포위공격했다. 영국의 버킹엄 공작이 레 섬에 상륙해 라 로셸을 지원했지만 국왕군은 포위를 강화하여 1628년 10월 항복을 받아냈다. 그러나 리슐리외는 추기경이었음에도 불구하고 신교도들에게 가혹하게 대하지 않았다. 그는 국가 내에 두 종교가 있는 것을 반대한 것이 아니라 당파를 반대한 것이었기 때문이다. 국왕에게 충성스러운 프랑스 인이라면 그에게는 어떤 종교를 가진 사람이라도 상관없었다. 1629년에 로앙 경의 신교도 군을 무찌르고 나서 맺은 알레의 강화에서도 이는 잘 드러난다. 신교도들은 군사적 자유는 잃었으되 신앙의 자유는 확보했다. 리슐리외는 이단의 개종은 무력으로 하는 것이 아니라 하늘을 바라보고 해야 하는 것이라고 말했다.

이렇게 신교도들을 잠재우고 나서 프랑스는 확고한 반 에스파냐 외교정책을 택했다. 이는 모후파의 격렬한 불만을 불러일으켰다. 모후와 가스통 도를레앙의 지원을 받은 국새상서 마리약은 1630년 에스파냐와 우호관계를 유지하여 빈궁한 백성과 나라 살림을 돌보는데 힘을 기울여야한다고 주장했다. 그러나 리슐리외와 "선량한 프랑스인" 파는 합스부르크 파의 팽창주의를 막아 프랑스의 자주성을 지켜야 한다고 대응했다.

1630년 11월 10일, 뤽상부르 궁에서 모후는 아들에게 추기경의 파면을 요구했다. 리슐리외가 나타나자 모후는 흥분하여 눈물을 흘리며 추기경에게 욕설을 퍼부었다.국왕은 침묵한채 궁을 나와 사냥을 떠났다. 모든 사람들은 모후가 승리했다고 믿었다. 모후파는 승리를 확신하고 그 날 하루 자축을 벌였다. 그러나 루이 13세는 베르사유의 사냥별장으로 들어가 몰래 리슐리외를 불렀다. 그리고 그를 파면하기는커녕 전적인 신임을 표명했다. 이 날이 바로 역사 상 「속은 자의 날」로 알려진 날이며 마리야크는 파직되고 가스통 도를레앙은 참수형을 받고 도망쳤으며 모후는 추방당했다.

완벽하게 권력을 잡은 리슐리외는 향후 5년간 「숨은전쟁」의 전략을 폈다. 이것은 합스부르크 왕가와 직접적인 부딪힘은 피한 채 합스부르크의 적들을 지원하면서 그 팽창을 막고자 하는 것이었다. 프랑스는 30년 전쟁에서 네덜란드, 스웨덴, 독일의 신교도 제후들을 지원했다. 리슐리외는 이 정책을 "소량이면 해독제가 되고 과다이면 치사제가 되는 방법" 이라고 표현했으나 이것의 필요성을 누구보다 확신하고 있었다. 그러나 이런 지원에도 불구하고 신교파가 괴멸직전에 몰리자 1635년 5월 19일, 프랑스는 '숨은 전쟁'을 버리고 직접적으로 에스파냐와 교전에 들어갔다. 전황은 처음에는 프랑스에게 불리했으나 점차 에스파냐 군을 몰아내기 시작했다. 1642년에는 오늘날의 프랑스의 자연국경까지 진출했다. 그러나 그해 리슐리외가 사망했고 루이 13세도 콩데 공의 아들이자 미래의 콩데 공인 앙기엥 공작이 로크루아에서 에스파냐 군을 괴멸시키기 5일 전인 1643년 5월 14일에 숨을 거두었다. 그는 죽기 직전에 앙기엥 공이 로크루아에서 승리할 것을 예언했다고 한다.